万县区原是重庆市辖区,1998年万县区更名为万州区,隶属于重庆市。
1949年,万县专区成立,隶属川东行政区。
1952年,万县专区改隶四川省。
1968年,建立万县地区。
1992年,撤销万县地区、万县、万县市,原万县地区置地级市万县市,原万县、万县市置龙宝区、天城区、五桥区。
1996年,万县市由四川省划属重庆市代管。
1997年,撤销万县市及其所辖的龙宝区、天城区、五桥区,设立重庆市万县区。
1998年,万县区更名万州区。
万州区地处四川盆地东缘,重庆市东北边缘,东邻云阳县,西连忠县、梁平区。南与石柱土家族自治县和湖北省利川市接壤,北接开州区和四川省开江县。
万州区山丘起伏,最高点位于普子乡七曜村沙坪峰,海拔1762米;最低点位于黄柏乡境内,随长江蓄水水位变化而变化。低山、丘陵面积约占四分之一,低中山和山间平地面积约占四分之一,极少平坝和台地,且零星散布。
万州区属亚热带季风湿润带,气候四季分明。